Продолжение истории Такаши Нацумэ, с раннего детства имеющего способность видеть духов. Нацумэ вместе со своим верным и пушистым телохранителем Нянко [斑] продолжает возвращать имена из «Тетради дружбы» своей бабушки Рэйко [夏目 レイコ], узнавая с каждым разом всё больше и больше о её необычной жизни, и вместе с этим всё глубже и сильнее погружаясь в таинственный и загадочный мир ёкаев, незаметно существующий для остальных людей и временами, как часто выясняется, с ними тесно пересекающийся.